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003.[vscode]ssh 원격서버에 비밀번호 없이 접속하기 위의 사진과 같이 비밀번호를 입력하라는 창이 뜬다. 이게 계속 들어가기 굉장히 귀찮다. 해결방법은 매우 간단하다. vscode ssh 원격서버에 비밀번호 없이 접속하는 방법 1. PowerShell 또는 명령 프롬프트(cmd)에 접속한다. 2. ssh-keygen -t rsa -b 4096 입력한다. ① file 위치 및 passphrase 지정이 필요없다면 모두 Enter 버튼 누르면 된다. ② 파일이 저장된 경로가 출력된다. 이 경로를 찾아 들어가면 id_rsa, id_rsa.pub 파일이 생성된 것을 알 수 있다. 3. id_rsa는 로컬 컴퓨터에 저장될 키이고, 공개키로 사용될 id_rsa.pub 파일을 원격서버로 복사해준다. (저는 파일 이동을 위해 Xftp 사용했으나 다른 프로그램 등을 사용해.. 2024. 3. 20.
002.[vscode]VSC 자동업데이트 끄기(비활성화) VSCode 자동 업데이트 끄는 방법 vscode 버전과 원격 연결한 서버 버전이 안 맞는다고 warning이 계속 떠서 다운그레이드하면 자꾸만 혼자 업데이트가 되길래 강제로 vsc 업데이트를 막아버렸다. Ctrl + Shift + P ➡️ Preferences: Open User Settings 접속 후 update mode 검색해서 설정을 none 으로 변경 2024. 2. 23.
001.[remote ssh]VScode 서버에 원격 접속하기 목차 1. Remote 관련 extension 설치하기 2-1. (간단버전) 원격 서버 호스트와 연결하기 2-2. (디테일버전) 원격 서버 호스트와 연결하기 3. 원격 서버 접속하기 1. Remote 관련 extension 설치하기 우측 메뉴에 있는 extension(Win 단축키: Ctrl + Shift + X / Mac은 Ctrl 대신 Cmd)에서 Remote Development를 설치한다. 원격서버 연결에 필요한 여러 extension이 포함되어 있는 pack(팩)이다. 2-1. (간단버전) 원격 서버 호스트와 연결하기 step 1. Ctrl + Shift + P 를 누르면 상단에 검색창에 Remote-SSH 를 검색하고 Remote-SSH: Connect to Host... 를 클릭한다. ste.. 2024. 2. 23.
[단일세포] scATAC-seq 10X cellranger-arc 원리 single cell multiome 10X library 및 cellranger-arc 원리에 대해 공부중이다. 추가로 공부하는 내용이 있다면 계속 추가할 예정이다. 1. 멀티옴 ATAC 라이브러리 구성 - P5, P7: Illumina amplification을 위한 서열 - 10X barcode: 세포를 구분하기 위한 cell barcode - Spacer: ATAC oligo barcode(바코드)로, transposed DNA fragments가 결합(attachment)할 수 있는 바코드 (길이 8bp) 2. ATAC matrix 가공 과정 multiome FASTQ를 가공하여 peak-barcode 매트릭스를 만들기 위해서는 cellranger-arc count 코드 한 줄만 입력하면 되지만.. 2024. 2. 20.
002.[R] 패키지 설치, 실행, 삭제, unload 방법 목차 1. 패키지 설치 및 실행(load) 하기 2. 패키지(라이브러리) 삭제(remove)하기 3. 패키지(라이브러리) unload 하기 4. R studio에서 직접 패키지 실행, 삭제, unload 하기 1. 패키지 설치 및 실행(load) 하기 패키지를 설치하는 기본적인 코드는 아래와 같다. 해당 코드 외에도 패키지를 배포하는 사이트(github 등)에서 개발자가 제안하는 코드를 실행하면 된다. install.packages("패키지명") 패키지를 설치한 후, 패키지를 실행하기 위해서는 라이브러리로 불러와야 한다. 패키지를 실행하는 코드는 아래와 같다. library(패키지명) # 패키지 명에 따옴표로 묶지 않아도 된다. 2. 패키지(라이브러리) 삭제(remove)하기 패키지를 삭제하기 위해서는 .. 2024. 1. 3.