scMulitome1 [단일세포] scATAC-seq 10X cellranger-arc 원리 single cell multiome 10X library 및 cellranger-arc 원리에 대해 공부중이다. 추가로 공부하는 내용이 있다면 계속 추가할 예정이다. 1. 멀티옴 ATAC 라이브러리 구성 - P5, P7: Illumina amplification을 위한 서열 - 10X barcode: 세포를 구분하기 위한 cell barcode - Spacer: ATAC oligo barcode(바코드)로, transposed DNA fragments가 결합(attachment)할 수 있는 바코드 (길이 8bp) 2. ATAC matrix 가공 과정 multiome FASTQ를 가공하여 peak-barcode 매트릭스를 만들기 위해서는 cellranger-arc count 코드 한 줄만 입력하면 되지만.. 2024. 2. 20. 이전 1 다음
