[Go install] golang compiler 패키지 설치하기

 목차 

1️⃣ Go 소개

2️⃣ Go로 패키지 설치하기

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1️⃣  Go 소개

Go 언어(줄여서 Go 또는 Golang)는

2007년 구글(Google)에서 개발된 오픈 소스 프로그래밍 언어이다.

 

Go는 간결함, 효율성, 병렬 처리를 쉽게 구현할 수 있도록 설계된 언어로,

주로 서버 개발이나 클라우드 기반 애플리케이션에서 널리 사용된다고 한다.

 

아직 Go에 대해 완벽히 파악하지 못했다...

 

🧐 conda, docker로 패키지 설치하듯 Go를 이용해 패키지를 설치할 수 있다. 🧐

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설치하고자 하는 패키지는 2024년 9월에 Genome Biology에 올라온 Enhlink이라는 툴이다.

https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-024-03374-9

Enhlink infers distal and context-specific enhancer–promoter linkages - Genome Biology

 

Enhlink은 golang compiler를 통해 패키지를 설치하라고 소개가 되어있다.

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2️⃣ Go로 패키지 설치하기

( 🔎  참고로, go는 conda install로 설치 가능하다.)

 

1) GOBIN 또는 GOPATH 설정 확인

 

1-1)  ✈️ GOBIN 또는 GOPATH의 경로 확인 ✈️

Go가 패키지를 설치한 디렉토리를 확인하기 위해 아래의 명령어를 터미널에 실행한다.

$ go env GOBIN

 

위의 명령어로 아무것도 출력이 되지 않았다면

Go가 기본 경로인 $GOPATH/bin에 패키지를 설치한다는 것이다.

 

이럴 때는 아래의 명령어로 $GOPATH 경로를 확인할 수 있다.

(나의 경우 Go 기본 경로가 /home/lifeisegg/go 라고 나옴)

$ go env GOPATH
/home/lifeisegg/go

 

1-2) ⛳ (옵션) PATH에 $GOPATH/bin 추가 ⛳

만약 $GOPATH/bin 이나 $GOBIN 경로가 PATH에 추가되지 않았다면,

이 경로를 시스템의 PATH에 추가해야 한다,

$ export PATH=$PATH:$(go env GOPATH)/bin

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2) 패키지 설치

✅ go install 로 설치하고자 하는 패키지를 설치한다.

 

go install 명령어는 Go 모듈을 통해 패키지를 설치하고,

패키지의 소스 코드를 컴파일하여 실행가능한 파일을 $GOPATH/bin 또는 $GOBIN에 저장한다.

### example
# go version >= 1.18
# Install enhlink
$ go install gitlab.com/Grouumf/enhlinktools/enhlink@latest
# Install enhgrid
$ go install gitlab.com/Grouumf/enhlinktools/enhgrid@latest
# Install enhtools
$ go install gitlab.com/Grouumf/enhlinktools/enhtools@latest

 

설치할 때 아래와 같이 나온다면 성공한 것이다!

go: downloading gitlab.com/Grouumf/enhlinktools/enhlink v0.0.0-20240905014251-972a77ac315a
go: downloading gitlab.com/Grouumf/enhlinktools v0.10.2
go: downloading gitlab.com/Grouumf/ATACdemultiplex/ATACdemultiplexUtils v0.0.0-20231204194046-760c57794d91
go: downloading gitlab.com/Grouumf/enhlinktools/matrix v0.0.0-20231204202714-1f1a9f51b6ff
go: downloading gitlab.com/Grouumf/enhlinktools/enhlinkobject v0.0.0-20240730164559-df9745395267
go: downloading github.com/biogo/hts v1.2.2
go: downloading github.com/jinzhu/copier v0.1.0
go: downloading github.com/biogo/store v0.0.0-20201120204734-aad293a2328f
go: downloading github.com/klauspost/pgzip v1.2.5
go: downloading github.com/dsnet/compress v0.0.1
go: downloading github.com/valyala/fastrand v1.1.0
go: downloading gonum.org/v1/gonum v0.14.0
go: downloading github.com/klauspost/compress v1.4.1
go: downloading github.com/klauspost/cpuid v1.2.0
go: downloading golang.org/x/exp v0.0.0-20230321023759-10a507213a29

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3) 설치확인

⭐ $GOBIN 또는 $GOPATH/bin 경로에 들어가 패키지 설치가 잘 되었는지 확인할 수 있다.

아래와 같이 설치한 패키지 폴더가 생성되었다면 성공적으로 설치가 된 것이다.

$ ls /home/lifeisegg/go/bin/
enhgrid  enhlink  enhtools

 

추가로 패키지 명령어를 실행하여 오류가 없는지 확인해 볼 수도 있다.